南京工程学院学报·自然科学版期刊论文现被知网收录(中)、维普收录(中)、万方收录(中)、国家图书馆馆藏、上海图书馆馆藏等数据库收录。

南京工程学院学报·自然科学版杂志创刊于2003年，发行周期为季刊，是一本科技类省级期刊，由南京工程学院主办，南京工程学院主管，内容节奏经过编排与改进，受到越来越多的读者喜爱。

杂志论文栏目设置：设计与制造工程、轨道交通与土木工程、基础科学等。