《上海交通大学学报·医学版》是自1958年创刊，国内刊号为31-2045/R，本刊积极探索、勇于创新，栏目设置及内容节奏经过编排与改进，受到越来越多的读者喜爱。它为医药卫生类综合性学术期刊，由上海交通大学主办，创刊于1958年，月刊，每月28日出版，国内外公开发行，其所有文章一经刊出均对读者免费开放。本刊以引导科技发展，培养学术人才，增进学术交流为办刊宗旨。刊登医学基础、临床、公共卫生等领域所取得的新成果、新理论、新技术、新经验；设有论著、综述、专题、专家论坛、述评、短篇论著、技术与方法、病例报告等栏目。本刊的目标读者是从事临床医学、基础医学、公共卫生、护理学、药学等专业的技术人员，包括临床医师、科研学者、教学工作者、医学在校生及相关人士。
该学报的主办单位上海交通大学拥有中国顶尖的医学院，师资力量雄厚，优势特色明显，学术成绩卓著，拥有教育部重点学科16个，临床学科、口腔学科、基础学科、药学4个学科为国家“双一流”建设学科。学院拥有数十名两院院士和数名欧洲科学院、美国科学院等国际机构的外籍院士，在多项学科综合排名中均位列全国医学院校首位。在美国《新闻与世界报道》2022年的高校学科排名中，上海交通大学临床医学世界排名第84位。医学院附属的瑞金医院、仁济医院、新华医院、第九人民医院、上海儿童医学中心等13家医疗机构拥有顶尖的医疗实力和科研实力。《上海交通大学学报(医学版)》拥有上海交大医学院系统丰厚的学术资源，与上海交通大学医学院及其附属医院的顶尖学术团队有着广泛而深入的合作，在组稿、审稿、编辑、顾问等方面获得了大量高水平的支持。
