学术期刊数字出版者包含学术期刊数字出版单位和出版从业者。学术期刊数字出版领域的突出问题就是学术期刊数字出版平台的寡头垄断，中国知网、万方数据和维普期刊等学术期刊数字出版平台已对传统学术期刊进行了全覆盖，没有给新生的学术期刊数字出版主体留下任何生存空间，从而制约甚至锁定了整个学术期刊数字出版行业创新和改革探索的可能。从出版伦理的角度来看，学术期刊数字出版主体违背了基本的伦理规范。
首先，学术期刊数字出版主体求大求全的数字出版模式违背了市场经济的基本规则，使学术期刊数字出版的发展置于自然的经济规律之上，从而导致学术期刊数字出版与市场经济规律渐行渐远。其次，学术期刊数字出版主体的自我中心论忽视了社会整体性，当传统学术期刊出版者面对学术期刊数字出版平台的“店大欺客”行为而无能为力时，传统学术期刊出版行业也就必然会受到学术期刊数字出版平台的打压，接下来的后果可能就是传统学术期刊出版质量下降，最终使学术期刊数字出版平台没有优质的学术内容以供传播，实质上还是“搬起石头砸了自己的脚”。
再次，学术期刊数字出版的制度设计过分强调工具理性，学术期刊数字出版平台一味追求科技理性和经济理性，不遗余力地提升学术内容搜索的便捷性和全面性，这种取向容易使学术共同体过分依赖数字信息而失去缜密思考的耐心，弱化了学术共同体的思想性和主体性。
最后，学术期刊数字出版主体忽视了传统文化的继承性，学术期刊数字出版平台的功利化取向背离了传统文化价值，不论与传统学术期刊出版者还是与其他学术期刊数字出版平台之间都缺乏“四海之内皆兄弟”的道德情怀，更看不到“己所不欲勿施于人”以及群己和谐的文化追求。因此，学术期刊数字出版行业的治理离不开出版伦理的建构，通过出版伦理的约束，能够使学术期刊数字出版主体在内心深处存在敬畏感，从而对冲技术层面和制度层面治理措施的滞后性和外在性。
学术期刊数字出版行业的有序发展需要伦理价值观和行为方式的变迁，更需要尊重自然经济规律、重塑数字出版文化以及重拾价值理性。没有出版伦理的支撑，学术期刊数字出版行业不可能健康发展，在中国建设具有国际影响力的学术期刊数字出版平台就将成为永远的梦想，中国学术交流体系的效率就很难提升，创新型国家的建设也难以实现。
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